广州市农业科学研究院发布染色体水平高质量菜心参考基因组
2023年6月29日广州市农业科学研究院与华南农业大学园艺学院共同合作在Plants（JCRQ1，IF=4.658）期刊发表了题为“A High-Continuity Genome Assembly of Chinese Flowering Cabbage (Brassica rapa var. parachinensis) Provides New Insights into Brassica Genome Structure Evolution《菜心高质量基因组组装及芸薹属基因组结构进化分析》”的研究论文，该研究破译了菜心基因组并揭示了菜心与芸薹属植物间基因组的进化关系。这也是全球首个栽培菜心品种染色体级别的高质量基因组序列研究报告。
研究团队利用PacBio三代测序技术，同时整合了Illumina和Hi-C的测序技术，对自主选育的‘油绿701菜心’品种进行了全基因组测序，获得了113Gb的PacBio和 47.5Gb Illumina 数据；使用Illumina数据评估测菜心基因组大小为515M；使用PacBio数据共组装出384Mb基因组序列，并结合Hi-C数据拼接出了10条染色体。该研究建立的菜心基因组数据库为菜心重要功能基因研究提供了宝贵的信息，并为研究芸薹属植物的基因组进化及菜心分子设计育种奠定了坚实的基础，具有重要的科学和应用价值。
该研究得到了广东省重点领域研发计划“现代种业”重大专项和广州市科技计划等项目的资助。
相关信息
-
分享到：
公安机关备案号：44011102001333
